北京时间6月25日，足协杯第3轮比赛全部战罢，16支中超球队本轮全部出战，但包括成都蓉城、沧州雄狮和深圳队在内，都是被低级别联赛球队淘汰。而河南队、长春亚泰、梅州客家、北京国安、青岛海牛、上海申花等中超球队，不是凭借点球大战晋级，就是1球险胜晋级到第4轮。而中甲的青岛西海岸，以及中乙的重庆铜梁龙和海门珂缔缘晋级。

第3轮足协杯赛果

延边龙鼎0-2大连人

四川九牛1-4浙江队

湖南湘涛0-1河南队

南京城市3-4长春亚泰

苏州东吴1-1（点球大战2-4）梅州客家

江西庐山1-5武汉三镇

淄博齐盛0-1北京国安

重庆铜梁龙（中乙）0-0（点球大战4-2）成都蓉城

丹东腾跃1-1（点球大战2-4）青岛海牛

青岛西海岸（中甲）2-1沧州雄狮

云南玉昆1-2上海申花

广州队1-3上海海港

东莞莞联1-6山东泰山

黑龙江冰城0-3南通支云

无锡吴钩0-2天津津门虎

海门珂缔缘（中乙）1-1（点球大战5-4）深圳队

按照足协杯的规定，低级别联赛球队对阵中超，有资格优先选择主场，而第3轮16支中超球队清一色做客，并且中超球队面对中乙球队必须使用全华班阵容。

而这样的规定，让河南队仅仅是1-0险胜湖南湘涛、北京国安1-0小胜淄博齐盛、上海申花最后时刻连入2球，2-1逆转了云南玉昆。

而梅州客家和青岛海牛，面对来自中甲的苏州东吴和丹东腾跃，则是依靠点球大战才涉险过关。

而中乙球队重庆铜梁龙则在点球大战将中超排名第2的成都蓉城淘汰，中甲的青岛西海岸则2-1淘汰了沧州雄狮。最后一场比赛，中乙球队海门珂缔缘则凭借点球大战将中超的深圳队淘汰。